La Coppa Italia Primavera 1999-2000 è stata la ventottesima edizione del torneo riservato alle squadre giovanili iscritte al Campionato Primavera. Il detentore del trofeo era il Torino.

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Coppa Italia Primavera 1999-2000
Competizione	Coppa Italia Primavera
Sport	Calcio
Edizione	28ª
Organizzatore	Lega Nazionale Professionisti
Luogo	Italia
Risultati
Vincitore	Atalanta (1º titolo)
Cronologia della competizione
1998-1999 2000-2001
Manuale

La vittoria finale è andata all'Atalanta per la prima volta nella sua storia.

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