Le qualificazioni del singolare maschile del Japan Open Tennis Championships 1999 sono state un torneo di tennis preliminare per accedere alla fase finale della manifestazione. I vincitori dell'ultimo turno sono entrati di diritto nel tabellone principale. In caso di ritiro di uno o più giocatori aventi diritto a questi sono subentrati i lucky loser, ossia i giocatori che hanno perso nell'ultimo turno ma che avevano una classifica più alta rispetto agli altri partecipanti che avevano comunque perso nel turno finale.
| Japan Open Tennis Championships 1999 Qualificazioni singolare maschile | ||||||||||||||||
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| Sport | ||||||||||||||||
| Tornei | ||||||||||||||||
| Singolare | uomini (q) | donne (q) | ||||||||||||||
| Doppio | uomini (q) | donne | ||||||||||||||
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Voce principale: Japan Open Tennis Championships 1999.
Le qualificazioni del torneo Japan Open Tennis Championships 1999 prevedevano 19 partecipanti di cui 7 sono entrati nel tabellone principale.
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| Primo turno | Ultimo turno | ||||||||||||
| 1 | 4 | 6 | |||||||||||
| 6 | 1 | 6 | 6 | 7 | |||||||||
| 13 | 4 | 6 | 3 | ||||||||||
| Primo turno | Ultimo turno | ||||||||||||
| 2 | 2 | 7 | 6 | ||||||||||
| 6 | 6 | 6 | 6 | 4 | |||||||||
| 14 | 3 | 3 | |||||||||||
| Primo turno | Ultimo turno | ||||||||||||
| 3 | 6 | 6 | 6 | ||||||||||
| 12 | 6 | 6 | 12 | 7 | 4 | 2 | |||||||
| 2 | 1 | ||||||||||||
| Primo turno | Ultimo turno | ||||||||||||
| 4 | 3 | 4 | |||||||||||
| 10 | 6 | 3 | 7 | 10 | 6 | 6 | |||||||
| 1 | 6 | 6 | |||||||||||
| Primo turno | Ultimo turno | ||||||||||||
| 5 | 6 | 7 | |||||||||||
| 11 | 6 | 6 | 11 | 4 | 6 | ||||||||
| 4 | 1 | ||||||||||||
| Primo turno | Ultimo turno | ||||||||||||
| 6 | 6 | 2 | 6 | ||||||||||
| 9 | 0 | 6 | 2 | ||||||||||
| Primo turno | Ultimo turno | ||||||||||||
| 7 | 6 | 6 | |||||||||||
| 8 | 3 | 3 | |||||||||||